结论：是的，指的是同一所学校
香港中文大学是这所学校的中文正式名称，The Chinese University of Hong Kong 是它的英文正式名称，CUHK 是这套英文名取的缩写。三个说法指向同一所学校，没有第二所同名院校。
所以在查资料的时候，看到「香港中文大学」「CUHK」混着出现，不用怀疑是不是两所学校，那是同一家在不同语境下的写法：中文材料里用中文名，英文材料、申请系统、学历文件里多用英文全称或 CUHK。
中大、香港中大：两个常用简称
除正式名称外，日常还会见到两个简称。一个是「中大」，用得最广，口语和港澳本地报道里最常见。另一个是「香港中大」，特点是把地区带上，在需要和别的「中大」区分、或者面向内地和海外读者的时候会用到。
这两个简称都不是官方另起的校名，只是习惯叫法。正式文件、成绩单、学位证书上出现的仍然是香港中文大学或 The Chinese University of Hong Kong，不会写成简称。
「中大」这个简称为什么会搞错
问题出在「中大」这个简称重合度太高。内地中山大学，日常也被叫作「中大」；台湾的国立中央大学，同样有「中大」这个叫法。三所学校的简称在字面上完全一样，只看两个字没法判断说的是哪一所。
处理办法很简单，就是看上下文。如果一段材料讲的是香港的高校、香港的院校列表、或者在香港本地语境下，「中大」基本指香港中文大学。如果材料讲的是内地高校或台湾高校，那多半是另外两所中的一所。判断不了的时候，往下找英文名或缩写——CUHK 这个缩写只对应香港中文大学，看到它就基本能确定。
反过来也成立：如果一份材料只写「中大」，通篇没有英文名、没有地区信息、也没有其他线索，那就先别急着当结论，回到原始出处确认一句。
查资料、填表格时的具体注意
第一，填在线申请表时，院校名称一栏优先按系统给的选项来选。很多系统里的下拉菜单是按英文全称或缩写建的，搜 Hong Kong 或 CUHK 往往比搜中文更快命中。如果系统允许手填，写英文全称 The Chinese University of Hong Kong 是最不容易出错的写法。
第二，做选校清单、核对院校资料的时候，建议每所学校固定记两个字段：中文正式名和英文缩写。这样后面比对官网信息、查认证名单、核对学历材料时，不会因为简称撞车把两所学校的信息串在一起。
第三，看中文媒体或论坛帖子时留个心。帖子里的「中大」到底指哪所，取决于发帖人的背景，不能默认。涉及具体项目信息时，最好顺藤摸到学校官网原文，而不是停在转述上。
第四，写邮件、填联系信息这类需要写校名的场合，用中文正式名或英文全称，不要用简称。简称适合口头和笔记，不适合给对方看。
顺带说一句缩写
CUHK 这个缩写里的 HK 代表 Hong Kong。有些材料会把它和其他带 CU 的缩写搞混，判断标准同样是看全称对照——缩写的每个字母都得和英文名对得上，对不上就不是同一所。
具体项目信息以学校官网当年发布为准。